RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 BBS12Q6ZW61 710 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MICAL2O94851 1124 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT7LO94864 414 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ACKR2O00590 384 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NCAM2O15394 837 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ENTPD5O75356 428 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CDK7P50613 346 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 OAZ1P54368 228 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKAA1Q13131 559 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 URGCPQ8TCY9 931 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PORCNQ9H237 461 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MPOP05164 745 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGB5P18084 799 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NCKAP1LP55160 1127 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEB16A2A368 324 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 H0Y626 953 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM16O95361 564 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB7AO95365 584 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PGAM1P18669 254 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GRTP1Q5TC63 336 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 IYDQ6PHW0 289 aa16.87■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D4O60343 1298 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TPST1O60507 370 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 WFS1O76024 890 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GLRA2P23416 452 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RBL1P28749 1068 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 POLIQ9UNA4 740 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DSG3P32926 999 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PCYT1AP49585 367 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH8P55286 799 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NAB1Q13506 487 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CHST12Q9NRB3 414 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 COG5Q9UP83 839 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 AP4S1Q9Y587 144 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIN2DO15399 1336 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DNM1LO00429 736 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 LYPLA2O95372 231 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC25CP30307 473 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 AVPR1AP37288 418 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MMP14P50281 582 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R40P59535 323 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF786Q8N393 782 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ALBP02768 609 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKAA2P54646 552 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RIN3Q8TB24 985 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 APOL2Q9BQE5 337 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RUBCNLQ9H714 662 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MCM8Q9UJA3 840 aa16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR27A2RRH5 827 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MEI4A8MW99 385 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V1C1P21283 382 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 LTN1O94822 1766 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WZ62 844 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BNIP1Q12981 228 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKDQ16760 1214 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR141Q7Z602 305 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms