RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28-201ENST00000368102 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 USP18Q9UMW8 372 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 UNCXA6NJT0 531 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 F5H423 210 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZWINTO95229 277 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 GNAT1P11488 350 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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SNHG28-201ENST00000368102 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 BBS12Q6ZW61 710 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PALM2Q8IXS6 379 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF276Q8N554 614 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PLXNB2O15031 1838 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 KBTBD13C9JR72 458 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 RNF8O76064 485 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 RAB27AP51159 221 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ARL4CP56559 192 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 OCRLQ01968 901 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NETO2Q8NC67 525 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 SNTG2Q9NY99 539 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 H0Y3Z8 333 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ENTPD5O75356 428 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 GSTA2P09210 222 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TUBP50607 506 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CDH6P55285 790 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TAZQ16635 292 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CFAP36Q96G28 342 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 A0A0G2JND7 137 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 E5RJQ4 531 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PPEF2O14830 753 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 HCRTO43612 131 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 UGT1A9O60656 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC22O60826 627 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 DPYSL3Q14195 570 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PTPN18Q99952 460 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNHG28-201ENST00000368102 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 FAAP100Q0VG06 881 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ACAP1Q15027 740 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC6Q16204 474 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CA9Q16790 459 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 TTC13Q8NBP0 860 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 HES2Q9Y543 173 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.59□□□□□ -0.07
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