RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TUBA4AP68366 448 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP1A4Q13733 1029 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM187BQ17R55 369 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC142Q17RM4 750 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 AWAT1Q58HT5 328 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MORC1Q86VD1 984 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT73Q86Y46 540 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDB2Q92466 427 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KAZALD1Q96I82 304 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 VPS50Q96JG6 964 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK33Q9BYT3 514 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 VPS45Q9NRW7 570 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC23Q9UJX2 597 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP83Q9Y592 693 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 H3BNC9 293 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHHO43323 396 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF2O60811 474 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPM1AP35813 382 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTR3AP46098 478 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPC5P78333 572 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFHR3Q02985 330 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXF2Q12947 444 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRM1Q13255 1194 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNASE1L3Q13609 305 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNJ12Q14500 433 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB30Q15771 203 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DENND2CQ68D51 928 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 P3H2Q8IVL5 708 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC17Q96LX7 622 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASB2Q96Q27 587 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP29Q9HBJ7 922 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FZD4Q9ULV1 537 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTBD19C9JJ37 291 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLIC1O00299 241 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDH17O14917 1159 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIP5K1BO14986 540 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FYB1O15117 783 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GCATO75600 419 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 VIPP01282 170 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SETSIPP0DME0 302 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP2D6P10635 497 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DRD1P21728 446 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALNSP34059 522 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TECP42680 631 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DGKQP52824 942 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTKQ06187 659 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC15Q0P6D6 951 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD13AQ14CX5 517 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM196Q5HYL7 178 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP78Q5JTW2 689 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM65Q6PI78 240 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms