RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.31□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.31□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.31□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRT37O76014 449 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNA1P02708 482 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 GJA1P17302 382 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 TMPRSS15P98073 1019 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 HIC1Q14526 733 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 SETDB1Q15047 1291 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf20Q8ND61 904 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 TIFAQ96CG3 184 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 TBL1XO60907 577 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 ARL4DP49703 201 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 SYTL3Q4VX76 610 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRRTM3-201ENST00000361320 MYH1P12882 1939 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 SCN9AQ15858 1988 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PQH9 124 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PRU2 124 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 EPHB6O15197 1021 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 GPC4O75487 556 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 GMNNO75496 209 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP25P42331 645 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 EPHB4P54760 987 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 SGCGQ13326 291 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 HIF1AQ16665 826 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM3-201ENST00000361320 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.3□□□□□ -1.24
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