RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 LAYNQ6UX15 382 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB22O15209 634 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 GHRP10912 638 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 AKR1A1P14550 325 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 YY1AP1Q9H869 796 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NID2Q14112 1375 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 C2orf81A6NN90 581 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NFICP08651 508 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CCDC130P13994 396 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TNFSF9P41273 254 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZNF280DQ6N043 979 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PGM2Q96G03 612 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RUBCNLQ9H714 662 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 AKAP10O43572 662 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZACNQ401N2 412 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 YAF2Q8IY57 180 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 FOPNLQ96NB1 174 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 OLFM3Q96PB7 478 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CACNA1FO60840 1977 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 LYPLA2O95372 231 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KDELR1P24390 212 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MARCKSL1P49006 195 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RAB27AP51159 221 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RALBP11234 206 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 AQP5P55064 265 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 EME1Q96AY2 570 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RNF19AQ9NV58 838 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 UBOX5O94941 541 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF8P28908 595 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CDT1Q9H211 546 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RRN3Q9NYV6 651 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 HOXA2O43364 376 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SOAT2O75908 522 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CCR1P32246 355 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 AMPD2Q01433 879 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 GTF2H3Q13889 308 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ADAM32Q8TC27 787 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NT5MQ9NPB1 228 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.015e-6■■■□□ 15.9
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NISCH-201ENST00000345716 CFAP99D6REC4 459 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NR2C2P49116 596 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RTP1P59025 263 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 BFSP2Q13515 415 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CYTH1Q15438 398 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 WNK4Q96J92 1243 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MYPNQ86TC9 1320 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RASSF10A6NK89 507 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 NUDT2P50583 147 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 OXCT1P55809 520 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 POU4F1Q01851 419 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CNGA2Q16280 664 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 MYBL2P10244 700 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SOX11P35716 441 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KLC1Q07866 573 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 ACOT9Q9Y305 439 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 LRG1P02750 347 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 CPA3P15088 417 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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