RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 COX16Q9P0S2 106 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FZD10Q9ULW2 581 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PTPRDP23468 1912 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 UPP2O95045 317 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FGFR3P22607 806 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NME3Q13232 169 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MTMR3Q13615 1198 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CTXN3Q4LDR2 81 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FUT10Q6P4F1 479 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 LRRC43Q8N309 656 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PQLC3Q8N755 202 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PLD5Q8N7P1 536 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PCDH19Q8TAB3 1148 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 B3GALT6Q96L58 329 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 RUFY1Q96T51 708 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MAGEB5Q9BZ81 275 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 C11orf49Q9H6J7 331 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SGK1O00141 431 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 APOL1O14791 398 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PBX3P40426 434 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ITGA8P53708 1063 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SLC9A4Q6AI14 798 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 NPNTQ6UXI9 565 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 BBOF1Q8ND07 529 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SCAMP5Q8TAC9 235 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 VWCEQ96DN2 955 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PIGVQ9NUD9 493 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 RRN3Q9NYV6 651 aa19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 MCF2LO15068 1137 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ETS1P14921 441 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A3P53794 718 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 CAV1Q03135 178 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 NOMO1Q15155 1222 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ZNF280DQ6N043 979 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 C1orf228Q6PIY5 440 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 RHBDF2Q6PJF5 856 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ADAM32Q8TC27 787 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 EDEM1Q92611 657 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ANAPC5Q9UJX4 755 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 VWA8A3KMH1 1905 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 OR6C75A6NL08 312 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF10BO14763 440 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 RBP3P10745 1247 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 TGM2P21980 687 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 RFC2P35250 354 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 P3H1Q32P28 736 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SCN4BQ8IWT1 228 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PYROXD2Q8N2H3 581 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SLC9A7Q96T83 725 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PLAAQ9Y263 795 aa19.94■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 IFNB1P01574 187 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PMS2P54278 862 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 IZUMO3Q5VZ72 239 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 VSTM1Q6UX27 236 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 RSAD2Q8WXG1 361 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PCDH9Q9HC56 1237 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa19.93■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 OPA1O60313 960 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 DGKIO75912 1065 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 GDF10P55107 478 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 GPS1Q13098 491 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SLMAPQ14BN4 828 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 PGLYRP2Q96PD5 576 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 CSPG4P5Q96PW8 444 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 SH3GL2Q99962 352 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 TRIM62Q9BVG3 475 aa19.92■□□□□ 0.78
UPP1-201ENST00000331803 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms