RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 RRN3Q9NYV6 651 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 STAP1Q9ULZ2 295 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C75A6NL08 312 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN9O14815 690 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TTI1O43156 1089 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 NOS2P35228 1153 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A52Q3SY17 297 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ERMARDQ5T6L9 678 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KAZNQ674X7 775 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP57Q86XR8 500 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC43Q8N309 656 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM199Q8N511 208 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT6Q8NCL4 622 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MYLPFQ96A32 169 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP57Q96MR6 1250 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK16Q96T55 309 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA8Q9NP80 782 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22.1
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB2P05107 769 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 IL1R2P27930 398 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2BP42772 138 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF6Q58WW2 860 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 KCNT1Q5JUK3 1230 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 VSIG1Q86XK7 387 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 JAMLQ86YT9 394 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB106AQ8N104 65 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SCML4Q8N228 414 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO2A1Q92959 643 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 61.7
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM129AQ9BZQ8 928 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DCLK3Q9C098 648 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM51Q9NW97 253 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MDM4O15151 490 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALT3O60512 393 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DAB1O75553 588 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 F9P00740 461 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT10P13645 584 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FGFR3P22607 806 aa10.54□□□□□ -0.72
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RABGGTB-201ENST00000319942 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC11A1P49279 550 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
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