RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 B4GALT4O60513 344 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 DEUP1Q05D60 604 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 MMRN1Q13201 1228 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TRNP1Q6NT89 227 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 HSPH1Q92598 858 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.14■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 CXCL11O14625 94 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ADCY6O43306 1168 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OPHN1O60890 802 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RARBP10826 455 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ADORA2AP29274 412 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TTLL4Q14679 1199 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 HBP1O60381 514 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FAM200BP0CF97 657 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CDC16Q13042 620 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CDO1Q16878 200 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NPNTQ6UXI9 565 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF276Q8N554 614 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SKA1Q96BD8 255 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 EBF3Q9H4W6 596 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 KCNK13Q9HB14 408 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TMCO1Q9UM00 188 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 B2RBV5 119 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 H3BRJ5 948 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 M0QYV0 167 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MICAL2O94851 1124 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RGS7P49802 495 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ILDR2Q71H61 639 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 XYLT1Q86Y38 959 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TTC17Q96AE7 1141 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CST8O60676 142 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PPIL2Q13356 520 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 BBS9Q3SYG4 887 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA24Q86W54 205 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ACTL9Q8TC94 416 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NAT14Q8WUY8 206 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NLRP7Q8WX94 980 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 A8MXQ7 604 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 COQ9O75208 318 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OR6B1O95007 311 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CDK16Q00536 496 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 KIZQ2M2Z5 673 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 EFHC2Q5JST6 749 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PALM2Q8IXS6 379 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PEBP4Q96S96 227 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NDE1Q9NXR1 346 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GRIA2P42262 883 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 FCHO1O14526 889 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PHBP35232 272 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 AP3M2P53677 418 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 GRM1Q13255 1194 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 PANX3Q96QZ0 392 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 BCO2Q9BYV7 579 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF554-201ENST00000317243 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms