RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 PES1O00541 588 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NDUFB5O43674 189 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KRT86O43790 486 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EXTL3O43909 919 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 USO1O60763 962 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GFPT2O94808 682 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 C8AP07357 584 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC172P0C7W6 258 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NR2F2P24468 414 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GDI1P31150 447 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 HOXA9P31269 272 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RDXP35241 583 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RARRES1P49788 294 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GPC3P51654 580 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ELF2Q15723 593 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 DGKKQ5KSL6 1271 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LCE1DQ5T752 114 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LIN9Q5TKA1 542 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 WDR59Q6PJI9 974 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RAD9BQ6WBX8 426 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SYT10Q6XYQ8 523 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SFR1Q86XK3 245 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MYCT1Q8N699 235 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LINC01465Q8N7H1 131 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CEP120Q8N960 986 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NEK11Q8NG66 645 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KIFAP3Q92845 792 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GJA10Q969M2 543 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FIZ1Q96SL8 496 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LXNQ9BS40 222 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CHST12Q9NRB3 414 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FAM105AQ9NUU6 356 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GDE1Q9NZC3 331 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 AIPL1Q9NZN9 384 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CNTN3Q9P232 1028 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EXOC7Q9UPT5 735 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ATG2BQ96BY7 2078 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FLNCQ14315 2725 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PATE3B3GLJ2 98 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 F8W810 466 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF623O75123 536 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TNFRSF21O75509 655 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RHOBTB1O94844 696 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GCNT3O95395 438 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 POMCP01189 267 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NR3C1P04150 777 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 POU2F2P09086 479 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PLS3P13797 630 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PRLRP16471 622 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CEBPBP17676 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CES1P23141 567 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PI4KAP42356 2102 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 OR1G1P47890 313 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RAB27AP51159 221 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GNG11P61952 73 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GTF2BQ00403 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CYP4A11Q02928 519 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CREMQ03060 361 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KCNA1Q09470 495 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CETN1Q12798 172 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SPA17Q15506 151 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PIP4P1Q86T03 277 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CEP112Q8N8E3 955 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 HPS3Q969F9 1004 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC42Q96M95 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SCLT1Q96NL6 688 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ACCSQ96QU6 501 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MUC3BQ9H195 1237 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms