RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC160A6NGH7 325 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF185O15231 689 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TJP3O95049 919 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MMP8P22894 467 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 HOXC8P31273 242 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 LMNB2Q03252 620 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TRIM60Q495X7 471 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PALB2Q86YC2 1186 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SCLYQ96I15 445 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 HSFY1Q96LI6 401 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TLR10Q9BXR5 811 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 COX16Q9P0S2 106 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 O00370 1275 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 NDUFB5O43674 189 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 GPD1P21695 349 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CYP2C18P33260 490 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 RCN2Q14257 317 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ARL13BQ3SXY8 428 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CTXN3Q4LDR2 81 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ANO7Q6IWH7 933 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 AGMOQ6ZNB7 445 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF554Q86TJ5 538 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 RCOR2Q8IZ40 523 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 C12orf29Q8N999 325 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CHMP6Q96FZ7 201 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TOX2Q96NM4 488 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 YME1L1Q96TA2 773 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CALN1Q9BXU9 219 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF180Q9UJW8 692 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 FBXO21O94952 628 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TUBP50607 506 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 KRT17Q04695 432 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MAMLD1Q13495 774 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CCT6BQ92526 530 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 BTBD6Q96KE9 485 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ENPP3O14638 875 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ATP6V1C1P21283 382 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 RFC2P35250 354 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ARL4AP40617 200 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ARPC4P59998 168 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MGAT3Q09327 533 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 INCA1Q0VD86 236 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SEPT6Q14141 434 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 INAQ16352 499 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TFAP2BQ92481 460 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 WNT8BQ93098 351 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 DRC3Q9H069 523 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 KRT82Q9NSB4 513 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PLAAQ9Y263 795 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 114.8
SLC13A3-202ENST00000290317 H0Y3Z8 333 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CES2O00748 559 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PSTPIP1O43586 416 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 GRAP2O75791 330 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 FGFR1P11362 822 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC130P13994 396 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MSH2P43246 934 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 BRCC3P46736 316 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 MAP3K7CLP57077 242 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 PPP2R2AP63151 447 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TFDP2Q14188 446 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ACAP1Q15027 740 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 LLGL1Q15334 1064 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 ZBTB6Q15916 424 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 QPCTQ16769 361 aa7.99□□□□□ -1.13
SLC13A3-202ENST00000290317 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms