RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277817.10

HERC4-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,371 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-201ENST00000277817 CEP83Q9Y592 693 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MAN2B1O00754 1011 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MOCS3O95396 460 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CTDNEP1O95476 244 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 H2AFZP0C0S5 128 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CCND1P24385 295 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CCNE1P24864 410 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 HOXD10P28358 340 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PRCPP42785 496 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SCAND1P57086 179 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CCDC6Q16204 474 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 H2AFVQ71UI9 128 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ZNF527Q8NB42 609 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 AMNQ9BXJ7 453 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 NDST4Q9H3R1 872 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PICK1Q9NRD5 415 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 X6R8D5 127 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 LCTP09848 1927 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CLRN2A0PK11 232 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MEGF11A6BM72 1044 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 KIAA0355O15063 1070 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 GRM6O15303 877 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FMO6PO60774 539 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ZBED4O75132 1171 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CLEC3AO75596 197 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FTCDO95954 541 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 F9P00740 461 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MT-ND3P03897 115 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 POLR2MP0CAP2 368 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 GAAP10253 952 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FGFR4P22455 802 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 NF2P35240 595 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 VPS41P49754 854 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 RCAN1P53805 252 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MXRA7P84157 204 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 C2orf54Q08AI8 447 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SPEM2Q0P670 501 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TRPC3Q13507 836 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MTF1Q14872 753 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ALX1Q15699 326 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 XKR9Q5GH70 373 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 NLRX1Q86UT6 975 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 KSR1Q8IVT5 923 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MB21D1Q8N884 522 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 Q8NFD4 153 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MGARPQ8TDB4 240 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 IQCDQ96DY2 449 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 MAML3Q96JK9 1138 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 CUEDC2Q9H467 287 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC4-201ENST00000277817 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms