RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 EPS8Q12929 822 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SLC29A2Q14542 456 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM60Q495X7 471 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRB-201ENST00000261266 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRB-201ENST00000261266 LLGL1Q15334 1064 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SZRD1Q7Z422 152 aa9.29□□□□□ -0.92
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