RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PRADC1-201ENST00000258083 HINFPQ9BQA5 517 aa23.33■■□□□ 1.33
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.33■■□□□ 1.33
PRADC1-201ENST00000258083 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.33■■□□□ 1.33
PRADC1-201ENST00000258083 MMP17Q9ULZ9 603 aa23.33■■□□□ 1.33
PRADC1-201ENST00000258083 CACNG3O60359 315 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 GABBR2O75899 941 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ADIGQ0VDE8 80 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 C2orf27AQ580R0 203 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 MIB1Q86YT6 1006 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 GAB3Q8WWW8 586 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 HHIPQ96QV1 700 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 DEC1Q9P2X7 70 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RAB23Q9ULC3 237 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.32■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 APBB3O95704 486 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RETP07949 1114 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SEC13P55735 322 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 EFEMP1Q12805 493 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ANO4Q32M45 955 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 PMF1Q6P1K2 205 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 NAT16Q8N8M0 369 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 P2RY11Q96G91 374 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 GMEB2Q9UKD1 530 aa23.31■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 E7ENQ6 273 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 AXIN1O15169 862 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 DAOAP59103 153 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 KDSRQ06136 332 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CRY1Q16526 586 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 LPAL2Q16609 132 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 MEA1Q16626 185 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RASSF3Q86WH2 238 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TERB1Q8NA31 727 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 HSFY1Q96LI6 401 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 DCLK3Q9C098 648 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 THAP9Q9H5L6 903 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.3■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 LRP3O75074 770 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RPP40O75818 363 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CALCAP01258 141 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TYRP14679 529 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 EMC10Q5UCC4 262 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 IRGQQ8WZA9 623 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 FAM81BQ96LP2 452 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 BBS2Q9BXC9 721 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 PARD6AQ9NPB6 346 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 FBXO10Q9UK96 956 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 HCN2Q9UL51 889 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CACNA1AO00555 2505 aa23.29■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 M0QYV0 167 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TRIM24O15164 1050 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ALLCQ8N6M5 410 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.27■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SGK1O00141 431 aa23.27■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 ADAM23O75077 832 aa23.27■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CISD3P0C7P0 127 aa23.27■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 SLC9A1P19634 815 aa23.27■■□□□ 1.32
PRADC1-201ENST00000258083 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms