RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SLC12A1Q13621 1099 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 WNT8BQ93098 351 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 HAUS8Q9BT25 410 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CARD9Q9H257 536 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZMYND10O75800 440 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TNFSF9P41273 254 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 NR2C2P49116 596 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 IRX4P78413 519 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SULT2A1Q06520 285 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 STAT4Q14765 748 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TRADDQ15628 312 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TPGS2Q68CL5 300 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 MON1AQ86VX9 555 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SCLYQ96I15 445 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ASB3Q9Y575 518 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ASTN1O14525 1302 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 HEATR9A2RTY3 570 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARL5CA6NH57 179 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 F2P00734 622 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 APODP05090 189 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ADRB2P07550 413 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 RRM1P23921 792 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.26□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SYN1P17600 705 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 BRCC3P46736 316 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SLC7A5Q01650 507 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ARID5BQ14865 1188 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 RBBP7Q16576 425 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 GPR158Q5T848 1215 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 FAM35AQ86V20 835 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TC2NQ8N9U0 490 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 C3orf20Q8ND61 904 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CASP10Q92851 521 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SNX27Q96L92 541 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 OMDQ99983 421 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 DUSP16Q9BY84 665 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SEPT3Q9UH03 358 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PMPCBO75439 489 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SUN1O94901 812 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TTC4O95801 387 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 GLI1P08151 1106 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 FNTAP49354 379 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PDCLQ13371 301 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PTK2BQ14289 1009 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SPARCL1Q14515 664 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ZACNQ401N2 412 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CEP68Q76N32 757 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SPATA24Q86W54 205 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 TRIB2Q92519 343 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 MBOAT7Q96N66 472 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SENP1Q9P0U3 644 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 HACD1B0YJ81 288 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 CYP2F1P24903 491 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SERPINA4P29622 427 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 ADCK2Q7Z695 626 aa8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NANOG-201ENST00000229307 LRGUKQ96M69 825 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms