RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 WBP2Q969T9 261 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 APODP05090 189 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PLA2G4AP47712 749 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 SYT13Q7L8C5 426 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 NAT16Q8N8M0 369 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 HHIPQ96QV1 700 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 USP3Q9Y6I4 520 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 K7EQS6 105 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 MDM4O15151 490 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PMM2O15305 246 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC192P0DO97 292 aa22.22■■□□□ 1.15
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TIMM50-216ENST00000601358 DMC1Q14565 340 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TMEM270Q6UE05 265 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 HTR3DQ70Z44 454 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 SCD5Q86SK9 330 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 MIB1Q86YT6 1006 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CEP250Q9BV73 2442 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 P4HA2O15460 535 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 KAT7O95251 611 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 VDRP11473 427 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TKTL1P51854 596 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 BCAT1P54687 386 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 KDSRQ06136 332 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 C12orf40Q86WS4 652 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TTC30AQ86WT1 665 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TMEM25Q86YD3 366 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 UBA3Q8TBC4 463 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 USP33Q8TEY7 942 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.21■■□□□ 1.15
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TIMM50-216ENST00000601358 ID4P47928 161 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PDE4CQ08493 712 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 RRAGAQ7L523 313 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 DEC1Q9P2X7 70 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 USP18Q9UMW8 372 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 AXIN1O15169 862 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 APBB3O95704 486 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 GRIA2P42262 883 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 EFEMP1Q12805 493 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TULP2O00295 520 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 ZBED1O96006 694 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 RETP07949 1114 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 HMBSP08397 361 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TIE1P35590 1138 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 COG7P83436 770 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 MESP2Q0VG99 397 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 RAB41Q5JT25 222 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF276Q8N554 614 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 UBR7Q8N806 425 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 GAB3Q8WWW8 586 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 KAT5Q92993 513 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 BBS2Q9BXC9 721 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.18■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TULP3O75386 442 aa22.18■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 PAEPP09466 180 aa22.18■■□□□ 1.14
TIMM50-216ENST00000601358 TNFRSF4P43489 277 aa22.18■■□□□ 1.14
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