RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCB6Q9NP58 842 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 CYP11B1P15538 503 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 VIPR2P41587 438 aa24.91■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 TC2NQ8N9U0 490 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF461Q8TAF7 563 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GATA6Q92908 595 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PANX2Q96RD6 677 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS45Q9NRW7 570 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMA1P25391 3075 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP13Q12802 2813 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 HCRTO43612 131 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPING1P05155 500 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ELF1P32519 619 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CCR2P41597 374 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CNGA2Q16280 664 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 KBTBD6Q86V97 674 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PRRG1O14668 218 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GIPC1O14908 333 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 THAP12O43422 761 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ABLIM3O94929 683 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SPINK2P20155 84 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ANXA13P27216 316 aa24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 CDK17Q00537 523 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 ORC1Q13415 861 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 MYLPFQ96A32 169 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 PCED1BQ96HM7 432 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.89■■□□□ 1.58
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CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2C2O75185 946 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-214ENST00000592483 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 E2F7Q96AV8 911 aa24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-214ENST00000592483 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-214ENST00000592483 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 VSTM1Q6UX27 236 aa24.87■■□□□ 1.57
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CAPNS1-214ENST00000592483 VPS36Q86VN1 386 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FUKQ8N0W3 1084 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf29Q8N999 325 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 MTMR11A4FU01 709 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC38A8A6NNN8 435 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-214ENST00000592483 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.86■■□□□ 1.57
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