RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MXRA7P84157 204 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PTH1RQ03431 593 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT32Q14532 448 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC29A2Q14542 456 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD1Q15327 319 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC57Q2TAC2 916 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR31Q5SQ13 230 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.675e-7■■■□□ 16.2
CAPNS1-210ENST00000590211 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PDSS2Q86YH6 399 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UCMAQ8WVF2 138 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP4Q8WY91 577 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP4K1Q92918 833 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM227BQ96M60 508 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 COG8Q96MW5 612 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NOX5Q96PH1 765 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 WRNIP1Q96S55 665 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NDC1Q9BTX1 674 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR35Q9HC97 309 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PREBQ9HCU5 417 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 JKAMPQ9P055 326 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH13Q9UKX3 1938 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087X0M5 115 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GX30 115 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF785A8K8V0 405 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO1CO00159 1063 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DNPH1O43598 174 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ORC4O43929 436 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TOX4O94842 621 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHA1P01876 353 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGCRP04035 888 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ACVR2AP27037 513 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CASRP41180 1078 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ETV4P43268 484 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CDR1P51861 262 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF7P61962 342 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 AP2B1P63010 937 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 VAMP2P63027 116 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE3AQ05086 875 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRNDQ07001 517 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC12A1Q13621 1099 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PKP1Q13835 747 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PCOLCEQ15113 449 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NECTIN1Q15223 517 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FCRL6Q6DN72 434 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF365Q70YC5 407 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RUFY3Q7L099 469 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 USP37Q86T82 979 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LDHDQ86WU2 507 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT73Q86Y46 540 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ABI1Q8IZP0 508 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RFFLQ8WZ73 363 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RTKNQ9BST9 563 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms