RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF21Q96ID5 467 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ERP44Q9BS26 406 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM66O15016 1216 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIK1P39086 918 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF6Q58WW2 860 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ATL2Q8NHH9 583 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9A7Q96T83 725 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CD48P09326 243 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PBX3P40426 434 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CDR1P51861 262 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 EPHB4P54760 987 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CDH6P55285 790 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NNTQ13423 1086 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DPYSL3Q14195 570 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 DPYSL2Q16555 572 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 USP41Q3LFD5 358 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 EMBQ6PCB8 327 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC13Q8NBP0 860 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FAF2Q96CS3 445 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF558Q96NG5 402 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 IL37Q9NZH6 218 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 LIASO43766 372 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ECEL1O95672 775 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 LAG3P18627 525 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC5A3P53794 718 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.392e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KAZNQ674X7 775 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CAVIN3Q969G5 261 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GALT6Q96L58 329 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 HINFPQ9BQA5 517 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FUT8Q9BYC5 575 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 COMMD8Q9NX08 183 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MTRRQ9UBK8 725 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ESYT3A0FGR9 886 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ACRP10323 421 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 IL4RP24394 825 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 GBP1P32455 592 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ1P48048 391 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 AIF1P55008 147 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 LMNB2Q03252 620 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TFDP2Q14188 446 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT81Q14533 505 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF157Q96PX1 679 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF670Q9BS34 389 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM51Q9NW97 253 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FZD10Q9ULW2 581 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR11A4FU01 709 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QYT0 321 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2K7O14733 419 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPN9O14815 690 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CST8O60676 142 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 VNN2O95498 520 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 F9P00740 461 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ECHS1P30084 290 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 L1CAMP32004 1257 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX1Q13596 522 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 PTK6Q13882 451 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TRADDQ15628 312 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 CA9Q16790 459 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-207ENST00000589146 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.72■■□□□ 1.39
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