RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS4O75173 837 aa25.1■■□□□ 1.61
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP350Q5VT06 3117 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACTL9Q8TC94 416 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF186Q9NXI6 227 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHKBQ9Y259 395 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYB561D2O14569 222 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRPSAP2O60256 369 aa25.06■■□□□ 1.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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