RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 KLHDC10Q6PID8 442 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 RHBDF2Q6PJF5 856 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 MIB1Q86YT6 1006 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ATRIPQ8WXE1 791 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 OTUB2Q96DC9 234 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 C2orf42Q9NWW7 574 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 RNF40O75150 1001 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ADH5P11766 374 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 OPRD1P41143 372 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 APBA1Q02410 837 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 CNGA2Q16280 664 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 MAN2A1Q16706 1144 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 EXOC3L4Q17RC7 722 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 GAB4Q2WGN9 574 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PKDCCQ504Y2 493 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 LY6G5CQ5SRR4 150 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PKN3Q6P5Z2 889 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 RASAL2Q9UJF2 1139 aa32.29■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 MFAP3P55082 362 aa32.28■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 STILQ15468 1287 aa32.28■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 MYOFQ9NZM1 2061 aa32.28■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ATG2BQ96BY7 2078 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 LCP1P13796 627 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 RGS7P49802 495 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 EFEMP1Q12805 493 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 FBXO43Q4G163 708 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PM20D1Q6GTS8 502 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 HTR3DQ70Z44 454 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF276Q8N554 614 aa32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 KCTD13Q8WZ19 329 aa32.27■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 CNTN6Q9UQ52 1028 aa32.27■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 PON1P27169 355 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SLC6A11P48066 632 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 NRLP54845 237 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP44Q17R89 818 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB44Q8NCP5 570 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 APEX2Q9UBZ4 518 aa32.26■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 ATG13O75143 517 aa32.25■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 GAD2Q05329 585 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 KCNJ12Q14500 433 aa32.25■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 PMF1Q6P1K2 205 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 C12orf40Q86WS4 652 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SLC35F5Q8WV83 523 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 FAM81BQ96LP2 452 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 NDST4Q9H3R1 872 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SPHK2Q9NRA0 654 aa32.25■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 K7ESF4 209 aa32.24■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 STC2O76061 302 aa32.23■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 KDSRQ06136 332 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 DMWDQ09019 674 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 MIIPQ5JXC2 388 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM25Q86YD3 366 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 NAT16Q8N8M0 369 aa32.23■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 CNGB3Q9NQW8 809 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 STRIP2Q9ULQ0 834 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 VPS13AQ96RL7 3174 aa32.23■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 MYO15AQ9UKN7 3530 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 YJEFN3A6XGL0 299 aa32.22■■■□□ 2.75
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