RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	COL1A2	P08123	1366 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PFKM	P08237	780 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB4	P48594	390 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	OVGP1	Q12889	678 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM110	Q86TL2	294 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SULF1	Q8IWU6	871 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PQLC3	Q8N755	202 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	STK32A	Q8WU08	396 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TTC17	Q96AE7	1141 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	MTBP	Q96DY7	904 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CNTN3	Q9P232	1028 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	MCM3AP	O60318	1980 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	AVIL	O75366	819 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	GRAP2	O75791	330 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS2	P05162	132 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RBL1	P28749	1068 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	EPHB2	P29323	1055 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CDK16	Q00536	496 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB16	Q05516	673 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1N	Q8N819	430 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3R2	O00459	728 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	KRT38	O76015	456 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	APRT	P07741	180 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP1	Q07960	439 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559		Q3C1V9	767 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	KIF12	Q96FN5	646 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NSL1	Q96IY1	281 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	MKS1	Q9NXB0	559 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	HESX1	Q9UBX0	185 aa		19.12	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	OTOF	Q9HC10	1997 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559		I3L4J1	428 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PEX11A	O75192	247 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	C1QA	P02745	245 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NR2C2	P49116	596 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RGS7	P49802	495 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	KRT72	Q14CN4	511 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PKDCC	Q504Y2	493 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PMF1	Q6P1K2	205 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	VPS52	Q8N1B4	723 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf29	Q8N999	325 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP7	Q8WX94	980 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SKA1	Q96BD8	255 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DERA	Q9Y315	318 aa		19.11	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CIT	O14578	2027 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	GCAT	O75600	419 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	APOE	P02649	317 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	BGN	P21810	368 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	GRM5	P41594	1212 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RAB6C	Q53S08	254 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ATG16L1	Q676U5	607 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PLLP	Q9Y342	182 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN1	O60635	241 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	VTN	P04004	478 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	GNAZ	P19086	355 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TPSB2	P20231	275 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NAA25	Q14CX7	972 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TPSAB1	Q15661	275 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		19.1	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		19.1	■□□□□ 0.65

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