RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF38	Q9H0F5	515 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TMX1	Q9H3N1	280 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS18	Q9NS28	235 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TLDC2	A0PJX2	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01553	A4QN01	128 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	GSTA4	O15217	222 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC16A4	O15374	487 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CUTA	O60888	179 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	NPTXR	O95502	500 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IDE	P14735	1019 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ATF2	P15336	505 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MUT	P22033	750 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CTNNB1	P35222	781 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DDIT3	P35638	169 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL2	P36404	184 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MC3R	P41968	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PTEN	P60484	403 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	OSTN	P61366	133 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TAP1	Q03518	808 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	STRN3	Q13033	797 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPS	Q13938	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SSPN	Q14714	243 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPA	Q15257	358 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK6	Q16659	721 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KIFAP3	Q92845	792 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DHX58	Q96C10	678 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PGBD4	Q96DM1	585 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP89	Q96ST8	783 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST12	Q9NRB3	414 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	DSE	Q9UL01	958 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	GDA	Q9Y2T3	454 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SCN1A	P35498	2009 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NCAN	O14594	1321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GVL5	298 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	B4GALT5	O43286	388 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LPXN	O60711	386 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	POMC	P01189	267 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKCB	P05771	671 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PYGM	P11217	842 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	PI3	P19957	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	AKAP5	P24588	427 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LIMS1	P48059	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00310	P59036	64 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT85	P78386	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NUCB2	P80303	420 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	EPC2	Q52LR7	807 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATXN3-238	ENST00000556288	NOTUM	Q6P988	496 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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