RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TERB1	Q8NA31	727 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FBXO32	Q969P5	355 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GABRG3	Q99928	467 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	IL37	Q9NZH6	218 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TSC2	P49815	1807 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATP8B3	O60423	1300 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQF6	199 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM92A	A1XBS5	289 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688		A8MXQ7	604 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NPC1	O15118	1278 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GJB3	O75712	270 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF883	P0CG24	379 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TNNI1	P19237	187 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATIC	P31939	592 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HOXD13	P35453	343 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TNNC1	P63316	161 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM193A	P78312	1265 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KDSR	Q06136	332 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MESP2	Q0VG99	397 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRPC3	Q13507	836 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HTR3D	Q70Z44	454 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GLRX5	Q86SX6	157 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CHPF	Q8IZ52	775 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DEFB119	Q8N690	84 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NAT16	Q8N8M0	369 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SMARCE1	Q969G3	411 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TNIP3	Q96KP6	325 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NACA2	Q9H009	215 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	USP25	Q9UHP3	1055 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCN1A	P35498	2009 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EML5	Q05BV3	1969 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GTW7	788 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SH3BP5	O60239	455 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CACNG3	O60359	315 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NDUFV2	P19404	249 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CD6	P30203	668 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CYP2J2	P51589	502 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EHHADH	Q08426	723 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PDZD3	Q86UT5	571 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TMEM25	Q86YD3	366 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NAXD	Q8IW45	347 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	RDH13	Q8NBN7	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25

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