RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CS-223	ENST00000551137	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137		O00370	1275 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LRP3	O75074	770 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ADH5	P11766	374 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RARG	P13631	454 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TGM1	P22735	817 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GRIA2	P42262	883 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF4	P43489	277 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BCAT1	P54687	386 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DMWD	Q09019	674 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137		Q6ZNB5	142 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	WBP2	Q969T9	261 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	NACA2	Q9H009	215 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	NAGPA	Q9UK23	515 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ZBED1	O96006	694 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RET	P07949	1114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SETSIP	P0DME0	302 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RALA	P11233	206 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SLC6A11	P48066	632 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ZNF132	P52740	706 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	COG7	P83436	770 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PDE4C	Q08493	712 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STIL	Q15468	1287 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CNGA2	Q16280	664 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DCLK2	Q8N568	766 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MED15	Q96RN5	788 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	NCDN	Q9UBB6	729 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STC2	O76061	302 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KAT7	O95251	611 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	APOD	P05090	189 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TKTL1	P51854	596 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STX17	P56962	302 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LRMP	Q12912	555 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DMC1	Q14565	340 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CAMK4	Q16566	473 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MEA1	Q16626	185 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TMEM270	Q6UE05	265 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	C12orf40	Q86WS4	652 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GAB3	Q8WWW8	586 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TFAP2B	Q92481	460 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LOXL4	Q96JB6	756 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DEC1	Q9P2X7	70 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TULP2	O00295	520 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CACNG3	O60359	315 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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