RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 C12orf40Q86WS4 652 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 CD101Q93033 1021 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 HESX1Q9UBX0 185 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ANTXRLA6NF34 631 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 K7ESF4 209 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 NR1H3Q13133 447 aa21.94■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.94■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ZNF276Q8N554 614 aa21.94■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ZBED1O96006 694 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 SETSIPP0DME0 302 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PON1P27169 355 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 CXCL12P48061 93 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 SLC6A11P48066 632 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PSEN1P49768 467 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 RGS7P49802 495 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 SLC8A3P57103 927 aa21.93■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PMF1Q6P1K2 205 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 GBP6Q6ZN66 633 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 HTR3DQ70Z44 454 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 BECN2A8MW95 431 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 M0QYV0 167 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 RNF40O75150 1001 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 KRT5P13647 590 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 DRD1P21728 446 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 P2RY11Q96G91 374 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.92■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 NDST4Q9H3R1 872 aa21.91■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 E7ENQ6 273 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PIK3R2O00459 728 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ADH1CP00326 375 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 KLKB1P03952 638 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 EFEMP1Q12805 493 aa21.9■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.9■■□□□ 1.1
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CS-222ENST00000550996 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.89■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.89■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 KCNJ18B7U540 433 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-222ENST00000550996 K7EQS6 105 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-222ENST00000550996 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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CS-222ENST00000550996 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CS-222ENST00000550996 MFAP3P55082 362 aa21.89■■□□□ 1.09
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