RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 UBXN6Q9BZV1 441 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SPHK2Q9NRA0 654 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 NUDT5Q9UKK9 219 aa12.45□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 BIN1O00499 593 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 MDM4O15151 490 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 LRP3O75074 770 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 RPP40O75818 363 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 KAT7O95251 611 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 APBB3O95704 486 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 APODP05090 189 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 GRIA2P42262 883 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PSEN1P49768 467 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SPEM2Q0P670 501 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 LRMPQ12912 555 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 RAB41Q5JT25 222 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ERMP1Q7Z2K6 904 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PIGZQ86VD9 579 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TTC30AQ86WT1 665 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM25Q86YD3 366 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PHTF2Q8N3S3 785 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF276Q8N554 614 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 UBR7Q8N806 425 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 EBF1Q9UH73 591 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 NAGPAQ9UK23 515 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 USP18Q9UMW8 372 aa12.44□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 BICDL2A1A5D9 508 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 AXIN1O15169 862 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC192P0DO97 292 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PLA2G4AP47712 749 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CRY1Q16526 586 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ANO4Q32M45 955 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 C10orf120Q5SQS8 335 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 BTBD8Q5XKL5 378 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 KBTBD6Q86V97 674 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC33Q8N5R6 958 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 NAT16Q8N8M0 369 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 LMO3Q8TAP4 145 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TULP2O00295 520 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TULP3O75386 442 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 RALAP11233 206 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TNFRSF4P43489 277 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 STX17P56962 302 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC8A3P57103 927 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 FOXK2Q01167 660 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 LMNB2Q03252 620 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 KDSRQ06136 332 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PDE4CQ08493 712 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SGO2Q562F6 1265 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 EMC10Q5UCC4 262 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 Q6ZNB5 142 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TADA2BQ86TJ2 420 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 IL17RCQ8NAC3 791 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 LOXL4Q96JB6 756 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 DEC1Q9P2X7 70 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TBC1D3BA6NDS4 549 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 SGK1O00141 431 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 O00370 1275 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIM24O15164 1050 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 P4HA2O15460 535 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 STC2O76061 302 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 GNA14O95837 355 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 VDRP11473 427 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 CD19P15391 556 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TIE1P35590 1138 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 TKTL1P51854 596 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 DGKEP52429 567 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 BCAT1P54687 386 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAMENP-203ENST00000548391 UBE2HP62256 183 aa12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms