RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548211.1

RPAP3-205, Transcript of RNA polymerase II associated protein 3, human

TSL 2

Gene RPAP3, Length 555 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPAP3-205	ENST00000548211	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ADGRB2	O60241	1585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	GLI3	P10071	1580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SLIT2	O94813	1529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ABCC5	O15440	1437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SOCS2	O14508	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	INSIG1	O15503	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DAPK1	P53355	1430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	USP1	O94782	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	FGB	P02675	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PRF1	P14222	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	KCNA3	P22001	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	LRPAP1	P30533	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PLCD1	P51178	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DGKE	P52429	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	KRT17	Q04695	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211		H3BNC9	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MET	P08581	1390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	FGA	P02671	866 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PXDN	Q92626	1479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211		E9PCH4	1651 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	MYMK	A6NI61	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CES2	O00748	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	DSCR3	O14972	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	GCAT	O75600	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	A1BG	P04217	495 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PRKCB	P05771	671 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CCKAR	P32238	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	CTBP1	Q13363	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	SEC23B	Q15437	767 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPAP3-205	ENST00000548211	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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