RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 MKS1Q9NXB0 559 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SNTG2Q9NY99 539 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 A8MXQ7 604 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 KBTBD13C9JR72 458 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 LPXNO60711 386 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 GCATO75600 419 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 KRT38O76015 456 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TGDSO95455 350 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MLNP12872 115 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 KCNE1P15382 129 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CYP2F1P24903 491 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 GJA5P36382 358 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 RGS7P49802 495 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TAF6P49848 677 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PDE4CQ08493 712 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MMRN1Q13201 1228 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TAF5Q15542 800 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CDO1Q16878 200 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MSS51Q4VC12 460 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CGB2Q6NT52 195 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 C1orf228Q6PIY5 440 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MOB2Q70IA6 237 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CYS1Q717R9 158 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ACOT1Q86TX2 421 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CCNJLQ8IV13 435 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 FITM2Q8N6M3 262 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MAML3Q96JK9 1138 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 13.5
CS-205ENST00000546891 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TINF2Q9BSI4 451 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SNX25Q9H3E2 840 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 USP29Q9HBJ7 922 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 NOD2Q9HC29 1040 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SBF1O95248 1867 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 H3BRJ5 948 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 11
CS-205ENST00000546891 PIRO00625 290 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 KLF11O14901 512 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 GPR32O75388 356 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 DAB1O75553 588 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 RECQL4O94761 1208 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 F2P00734 622 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SMPD1P17405 629 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CCND1P24385 295 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PRKCHP24723 683 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ARL4AP40617 200 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 NEK3P51956 506 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 AIF1P55008 147 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CDK18Q07002 472 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 SLC1A5Q15758 541 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 CCL15Q16663 113 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 WLSQ5T9L3 541 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 TRNP1Q6NT89 227 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 PMF1Q6P1K2 205 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-205ENST00000546891 ZNF449Q6P9G9 518 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms