RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545698.1

TDG-210, Transcript of thymine DNA glycosylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TDG, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDG-210ENST00000545698 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 IL37Q9NZH6 218 aa20.09■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 SPEGQ15772 3267 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 ATRXP46100 2492 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 TRIM24O15164 1050 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 TLR5O60602 858 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 P4HA1P13674 534 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 CCDC130P13994 396 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 AP3M2P53677 418 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 ZNF33AQ06730 810 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 CHPFQ8IZ52 775 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 FUKQ8N0W3 1084 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 GATA6Q92908 595 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 BBS2Q9BXC9 721 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 SDCBP2Q9H190 292 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TDG-210ENST00000545698 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.08■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 FAM92AA1XBS5 289 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 OPHN1O60890 802 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ZNF217O75362 1048 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 YEATS4O95619 227 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SERPINF2P08697 491 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 MAP3K7CLP57077 242 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SEMA3BQ13214 749 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ORC1Q13415 861 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PIP4P1Q86T03 277 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 MIB1Q86YT6 1006 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SMOQ99835 787 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.07■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 A0A1W2PQF6 199 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 BEST1O76090 585 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 TYRP14679 529 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 AFMP43652 599 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 HTR3DQ70Z44 454 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ACOX2Q99424 681 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 HCN2Q9UL51 889 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.06■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CACNG3O60359 315 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 VNN1O95497 513 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 TBX18O95935 607 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 NDUFV2P19404 249 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 PGFP49763 221 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 NDST1P52848 882 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CAPN10Q9HC96 672 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.84e-12■■■■■ 83.8
TDG-210ENST00000545698 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.05■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 BAHCC1Q9P281 2608 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 NDUFS2O75306 463 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 SYPP08247 313 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 FAM200BP0CF97 657 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 ADORA2BP29275 332 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CLDN10P78369 228 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 CUL4BQ13620 913 aa20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TDG-210ENST00000545698 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms