RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543446.1

IPO8-208, Transcript of importin 8, human

TSL 4

Gene IPO8, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IPO8-208	ENST00000543446	SPRY2	O43597	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ARRB2	P32121	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ENTPD1	P49961	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	P2RX3	P56373	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MTMR1	Q13613	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	KEAP1	Q14145	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ODF1	Q14990	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446		F8W810	466 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	AKAP10	O43572	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	KATNA1	O75449	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PLAU	P00749	431 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446		A0A087WWL8	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	POLD2	P49005	469 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	LTB	Q06643	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PTGR1	Q14914	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	HOXB2	P14652	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	MLH1	P40692	756 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TIRAP	P58753	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	EGR4	Q05215	589 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	FYB1	O15117	783 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446		A0A087WYN8	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ZNF432	O94892	652 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	UQCRC1	P31930	480 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	EVA1C	P58658	441 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	POU2F2	P09086	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
IPO8-208	ENST00000543446	IGBP1	P78318	339 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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