RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534323.1

BBOX1-208, Transcript of gamma-butyrobetaine hydroxylase 1, human

TSL 2

Gene BBOX1, Length 457 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBOX1-208	ENST00000534323	PFKL	P17858	780 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PROZ	P22891	400 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PSMA5	P28066	241 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	OR1D2	P34982	312 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	BRCC3	P46736	316 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	LIG3	P49916	1009 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CLCNKB	P51801	687 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SATB1	Q01826	763 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	MAPK7	Q13164	816 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	LAPTM5	Q13571	262 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TFDP1	Q14186	410 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CALCRL	Q16602	461 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ME3	Q16798	604 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	UPP1	Q16831	310 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	XKR4	Q5GH76	650 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	LIN9	Q5TKA1	542 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	VIT	Q6UXI7	678 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323		Q6ZS52	159 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	MTSS1L	Q765P7	747 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TMC8	Q8IU68	726 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	GTF3C6	Q969F1	213 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CHFR	Q96EP1	664 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TCTN2	Q96GX1	697 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	FRMD6	Q96NE9	622 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	HDAC8	Q9BY41	377 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CDT1	Q9H211	546 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	POLD4	Q9HCU8	107 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	PARP2	Q9UGN5	583 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	DPP7	Q9UHL4	492 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.91	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	IGF2R	P11717	2491 aa		3.9	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.9	□□□□□ -1.78
BBOX1-208	ENST00000534323	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	TMEM82	A0PJX8	343 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323		K7ESF4	209 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	ACKR2	O00590	384 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	MATN3	O15232	486 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	LAMTOR5	O43504	91 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM189A1	O60320	539 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	B3GAT3	O94766	335 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	ABLIM3	O94929	683 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	REC8	O95072	547 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	PRAMEF12	O95522	483 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	TH	P07101	528 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	GJA1	P17302	382 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	CYP11B2	P19099	503 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	KRT2	P35908	639 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	VIPR2	P41587	438 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	NAMPT	P43490	491 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	LIMS1	P48059	325 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	SOX9	P48436	509 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	EPHA5	P54756	1037 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	CYP4F8	P98187	520 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	LPAL2	Q16609	132 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BBOX1-208	ENST00000534323	CEP57	Q86XR8	500 aa		3.9	□□□□□ -1.79

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