RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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PTPRJ-206ENST00000534219 DGKEP52429 567 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRJ-206ENST00000534219 MESP2Q0VG99 397 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.27■■□□□ 1.8
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PTPRJ-206ENST00000534219 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
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PTPRJ-206ENST00000534219 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRJ-206ENST00000534219 HESX1Q9UBX0 185 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRJ-206ENST00000534219 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.23■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.22■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 CETN1Q12798 172 aa26.22■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa26.22■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 EOGTQ5NDL2 527 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-206ENST00000534219 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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PTPRJ-206ENST00000534219 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-206ENST00000534219 NT5C1BQ96P26 610 aa26.21■■□□□ 1.79
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