RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527018.5

CTSC-204, Transcript of cathepsin C, human

TSL 5

Gene CTSC, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-204	ENST00000527018	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	WBP2	Q969T9	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SMO	Q99835	787 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	VNN1	O95497	513 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	TBX18	O95935	607 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	NTSR1	P30989	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	NDST1	P52848	882 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CEP76	Q8TAP6	659 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	BHMT	Q93088	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62	1e-6	■■■■■ 161.5
CTSC-204	ENST00000527018	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	OPHN1	O60890	802 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	NDUFS2	O75306	463 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	BEST1	O76090	585 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	KIF20A	O95235	890 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	TYR	P14679	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PGF	P49763	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	DLG4	P78352	724 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ACOX2	Q99424	681 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	MDM4	O15151	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CYP26A1	O43174	497 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	CACNG3	O60359	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ZNF217	O75362	1048 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	SERPINF2	P08697	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	NDUFV2	P19404	249 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HOXD12	P35452	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	DGKG	P49619	791 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	STK4	Q13043	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTSC-204	ENST00000527018	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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