RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	HR	O43593	1189 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KAT7	O95251	611 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	APBB3	O95704	486 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TBX18	O95935	607 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	RET	P07949	1114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PAEP	P09466	180 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	GRIA2	P42262	883 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KDSR	Q06136	332 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	CAMK4	Q16566	473 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393		K7EQS6	105 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	AXIN1	O15169	862 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	LRP3	O75074	770 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ZBED1	O96006	694 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SDHB	P21912	280 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC6A11	P48066	632 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PGF	P49763	221 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TKTL1	P51854	596 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	COG7	P83436	770 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	LMNB2	Q03252	620 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	STIL	Q15468	1287 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	MDM4	O15151	490 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	DGKE	P52429	567 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	GCNT1	Q02742	428 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PDE4C	Q08493	712 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	EOGT	Q5NDL2	527 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393		O00370	1275 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TULP3	O75386	442 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	STC2	O76061	302 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	TIE1	P35590	1138 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	CHKA	P35790	457 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	ELF2	Q15723	593 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBBP4-215	ENST00000524393	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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