RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.17□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CD4P01730 458 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KRT15P19012 456 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 S100A1P23297 94 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FLT3LGP49771 235 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PEX5P50542 639 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA8P53708 1063 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SULT2A1Q06520 285 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CRHR2Q13324 411 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KYNUQ16719 465 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SNF8Q96H20 258 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TWNKQ96RR1 684 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CGREF1Q99674 301 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 EPN3Q9H201 632 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 BIRC5O15392 142 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ASPAP45381 313 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TAF6P49848 677 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RAD23BP54727 409 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 USP46P62068 366 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CTAG1AP78358 180 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SNX17Q15036 470 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CST9Q5W186 159 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TTC27Q6P3X3 843 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 EXD1Q8NHP7 514 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZFP42Q96MM3 310 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 APBA2Q99767 749 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SIX4Q9UIU6 781 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PAEPP09466 180 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GHRP10912 638 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MTTPP55157 894 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN10P78369 228 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CD302Q8IX05 232 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 BBOF1Q8ND07 529 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TTC16Q8NEE8 873 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HASPINQ8TF76 798 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TNIP3Q96KP6 325 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GAD1Q99259 594 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DRC3Q9H069 523 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 COL1A2P08123 1366 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KPNA7A9QM74 516 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 B3GAT3O94766 335 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RBP3P10745 1247 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TCF4P15884 667 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GPD1P21695 349 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GRM5P41594 1212 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PDE1BQ01064 536 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NME3Q13232 169 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LRP8Q14114 963 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 BBS9Q3SYG4 887 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA18Q8TC71 538 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ACTL9Q8TC94 416 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RAET1EQ8TD07 263 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF5Q92565 580 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PMM1Q92871 262 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.15□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.15□□□□□ -1.1
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