RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514893.5

NEDD4-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4-211	ENST00000514893	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PLAU	P00749	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	NFATC4	Q14934	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	EXOC5	O00471	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	FYB1	O15117	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	EPN2	O95208	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	RASAL1	O95294	804 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ALDH2	P05091	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	GATM	P50440	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ARFIP2	P53365	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	RAB32	Q13637	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	POLD2	P49005	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	WBP1	Q96G27	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	COG5	Q9UP83	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEDD4-211	ENST00000514893	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893		A8MVJ9	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893		F8W810	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	MLH1	P40692	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	P2RX3	P56373	397 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	GPC5	P78333	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PPAT	Q06203	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PTGR1	Q14914	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	MED30	Q96HR3	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893		A0A1W2PPL8	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	AP1G1	O43747	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	ADRA1D	P25100	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	ARRB2	P32121	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	RAB1A	P62820	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	KEAP1	Q14145	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	PIGK	Q92643	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms