RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIA2P42262 883 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFRSF4P43489 277 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARSP56192 900 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMC1Q14565 340 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCD5Q86SK9 330 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIGZQ86VD9 579 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBR7Q8N806 425 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAB3Q8WWW8 586 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAGPAQ9UK23 515 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIN1O00499 593 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APBB3O95704 486 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VDRP11473 427 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXK2Q01167 660 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAK1Q13153 545 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPAL2Q16609 132 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGO2Q562F6 1265 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C10orf120Q5SQS8 335 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP68Q76N32 757 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM25Q86YD3 366 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMO3Q8TAP4 145 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WBP2Q969T9 261 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NT5C1BQ96P26 610 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HESX1Q9UBX0 185 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AXIN1O15169 862 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPP40O75818 363 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAEPP09466 180 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRF1P10914 325 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDHBP21912 280 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCAT1P54687 386 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COG7P83436 770 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP8P85298 464 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRMPQ12912 555 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf27AQ580R0 203 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf40Q86WS4 652 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC30AQ86WT1 665 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHTF2Q8N3S3 785 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOXL4Q96JB6 756 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARK1Q9P0L2 795 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEC1Q9P2X7 70 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMP17Q9ULZ9 603 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTNND2Q9UQB3 1225 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBED1O96006 694 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TKTL1P51854 596 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC13P55735 322 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMNB2Q03252 620 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE4CQ08493 712 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNH2Q12809 1159 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANO4Q32M45 955 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERMP1Q7Z2K6 904 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RMDN1Q96DB5 314 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HHIPQ96QV1 700 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMXL1Q9Y485 3027 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP250Q9BV73 2442 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TULP3O75386 442 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC192P0DO97 292 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD19P15391 556 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGKEP52429 567 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STX17P56962 302 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCNT1Q02742 428 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPEM2Q0P670 501 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MESP2Q0VG99 397 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRY1Q16526 586 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM270Q6UE05 265 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZNB5 142 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RASSF3Q86WH2 238 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms