RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	AP1G2	O75843	785 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OLFM2	O95897	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC130	P13994	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRKCI	P41743	596 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	IFNAR2	P48551	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC5A3	P53794	718 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC7A9	P82251	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PON2	Q15165	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554		R4GN57	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTPRD	P23468	1912 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYP26A1	O43174	497 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	GFPT2	O94808	682 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ABL1	P00519	1130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARSA	P15289	507 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CD58	P19256	250 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	STAT1	P42224	750 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CXCL12	P48061	93 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TUB	P50607	506 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	RAD23B	P54727	409 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	NRL	P54845	237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCZ1B	P86790	482 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	NR1H3	Q13133	447 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ORC1	Q13415	861 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCIN	Q13939	588 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	NELL1	Q92832	810 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	CHP1	Q99653	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	SMO	Q99835	787 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OBSL1	O75147	1896 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SCAMP4-208	ENST00000489554	LEFTY2	O00292	366 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms