RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ACER1Q8TDN7 264 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ASB10Q8WXI3 467 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RNF31Q96EP0 1072 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DKK2Q9UBU2 259 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SWAP70Q9UH65 585 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TNKSO95271 1327 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRG0 241 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ERICH2A1L162 156 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PIPSLA2A3N6 862 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC69A6NI79 296 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 EEF2P13639 858 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NF2P35240 595 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ADRA1BP35368 520 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 BLOC1S1P78537 153 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 WTAPQ15007 396 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ME3Q16798 604 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CST9Q5W186 159 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 IQCA1Q86XH1 822 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM47Q9BQJ4 181 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CPVLQ9H3G5 476 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LY9Q9HBG7 655 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZHX2Q9Y6X8 837 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GTW7 788 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM75PA6NK02 468 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ALAS1P13196 640 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 AGXTP21549 392 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A2P23975 617 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LMO1P25800 156 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PCSK1P29120 753 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A9P48067 706 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OCA2Q04671 838 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ICA1Q05084 483 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ST3GAL1Q11201 340 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SPP2Q13103 211 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 VGLL4Q14135 290 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MICU3Q86XE3 530 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HSCBQ8IWL3 235 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CNTD1Q8N815 330 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1NQ8N819 430 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HOOK2Q96ED9 719 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TMX3Q96JJ7 454 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC17Q96LX7 622 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 COQ10AQ96MF6 247 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MYOCQ99972 504 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KAT14Q9H8E8 782 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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