RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 E7ENQ6 273 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 USP46P62068 366 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 FAM149B1Q96BN6 582 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 FBXO44Q9H4M3 255 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 HYOU1Q9Y4L1 999 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 PRRG1O14668 218 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 GPD1P21695 349 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CASQ1P31415 396 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 HFE2Q6ZVN8 426 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 PEX26Q7Z412 305 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CPNE8Q86YQ8 564 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 RXFP2Q8WXD0 754 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 COMMD8Q9NX08 183 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CD207Q9UJ71 328 aa27.11■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 FAM92AA1XBS5 289 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 ENC1O14682 589 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 DAB1O75553 588 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 COMTP21964 271 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 PSMA2P25787 234 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 MAN1A1P33908 653 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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SOBP-202ENST00000477448 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 MEI1Q5TIA1 1274 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 NIPA2Q8N8Q9 360 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 GIPC2Q8TF65 315 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 ZNF592Q92610 1267 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SCML2Q9UQR0 700 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.1■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CTAGE9A4FU28 777 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 DPYSL4O14531 572 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 MBTPS2O43462 519 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 GLUD1P00367 558 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31D3P0C874 917 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 PDGFRAP16234 1089 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SLC1A1P43005 524 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 ALDH1A3P47895 512 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 CLCN4P51793 760 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 MTMR3Q13615 1198 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 SLC2A13Q96QE2 648 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 APOL5Q9BWW9 433 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 POPDC2Q9HBU9 364 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 AMFRQ9UKV5 643 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa27.09■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 LTFP02788 710 aa27.08■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
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SOBP-202ENST00000477448 DEFB106AQ8N104 65 aa27.08■■□□□ 1.93
SOBP-202ENST00000477448 KIF18AQ8NI77 898 aa27.08■■□□□ 1.93
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SOBP-202ENST00000477448 TLR10Q9BXR5 811 aa27.08■■□□□ 1.93
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SOBP-202ENST00000477448 YWHAQP27348 245 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 MATKP42679 507 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 TWF1Q12792 350 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 CCDC14Q49A88 953 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 KREMEN2Q8NCW0 462 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 CFAP57Q96MR6 1250 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 CNPY3Q9BT09 278 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 CD320Q9NPF0 282 aa27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 OBSL1O75147 1896 aa27.07■■□□□ 1.92
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SOBP-202ENST00000477448 PTPN9P43378 593 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.06■■□□□ 1.92
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SOBP-202ENST00000477448 CD101Q93033 1021 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 EPCAMP16422 314 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 NOS2P35228 1153 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
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SOBP-202ENST00000477448 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 BSPRYQ5W0U4 402 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 CCDC149Q6ZUS6 474 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 SCD5Q86SK9 330 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 FBXO32Q969P5 355 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 HES6Q96HZ4 224 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 USTQ9Y2C2 406 aa27.06■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 TTC28Q96AY4 2481 aa27.05■■□□□ 1.92
SOBP-202ENST00000477448 DENND4CQ5VZ89 1909 aa27.05■■□□□ 1.92
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