RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468531.1

PTP4A2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, humanhuman

TSL 3

Gene PTP4A2, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2-202ENST00000468531 FAM221AA4D161 298 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ZNF233A6NK53 670 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 H7C4K7 107 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SYN3O14994 580 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TGFB1I1O43294 461 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CLSTN1O94985 981 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ITGB3P05106 788 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 MYL1P05976 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ADRB2P07550 413 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ELF1P32519 619 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 LILRA4P59901 499 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ITIH3Q06033 890 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 BFSP1Q12934 665 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 FBLN7Q53RD9 439 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 LIN9Q5TKA1 542 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ZNF280DQ6N043 979 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 GPR65Q8IYL9 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 MFSD4AQ8N468 514 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 APPL2Q8NEU8 664 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SUSD6Q92537 303 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SENP8Q96LD8 212 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 POMKQ9H5K3 350 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 MTRRQ9UBK8 725 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 DPP7Q9UHL4 492 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 C2CD2Q9Y426 696 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ANO9A1A5B4 782 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 M0QZQ0 153 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PIRO00625 290 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CYB561D2O14569 222 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PRRG1O14668 218 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CCL16O15467 120 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 EXOC3O60645 756 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CILPO75339 1184 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TNNC2P02585 160 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PF4P02776 101 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 OR4Q2P0C623 313 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ODC1P11926 461 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TNNI1P19237 187 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 TAF6P49848 677 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CDR1P51861 262 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ROR1Q01973 937 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 LMNB2Q03252 620 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 IKZF1Q13422 519 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 RAB33AQ14088 237 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SURF1Q15526 300 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SV2CQ496J9 727 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 LILRA6Q6PI73 481 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 GPR149Q86SP6 731 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 METTL23Q86XA0 190 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ASB11Q8WXH4 323 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 SMARCE1Q969G3 411 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2-202ENST00000468531 ZNF560Q96MR9 790 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms