RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PASD1	Q8IV76	773 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SPAG5	Q96R06	1193 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MIS12	Q9H081	205 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GAN	Q9H2C0	597 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CYLD	Q9NQC7	956 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	COL4A2	P08572	1712 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MAN2B1	O00754	1011 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GPD2	P43304	727 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SOX9	P48436	509 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM3C	Q92520	227 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ATP2A3	Q93084	1043 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	HSFY1	Q96LI6	401 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM170B	A6NMN3	283 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902		F8VZ95	297 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	TEX33	O43247	280 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PI15	O43692	258 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GFPT2	O94808	682 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	TCF3	P15923	654 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	AOC1	P19801	751 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	EFEMP1	Q12805	493 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CPA6	Q8N4T0	437 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	RNF139	Q8WU17	664 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	EDEM1	Q92611	657 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA1	Q92805	767 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	HPS4	Q9NQG7	708 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CEP83	Q9Y592	693 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		18.62	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902		E7ENQ6	273 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	EPHB6	O15197	1021 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FBXO21	O94952	628 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GLUL	P15104	373 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CYP11B1	P15538	503 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ACADSB	P45954	432 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MRE11	P49959	708 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	DAOA	P59103	153 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NR1H3	Q13133	447 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	EML3	Q32P44	896 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	TAF3	Q5VWG9	929 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PJA1	Q8NG27	643 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NELL2	Q99435	816 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	E2F8	A0AVK6	867 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	GABBR2	O75899	941 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NFATC1	O95644	943 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	HMBS	P08397	361 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CTH	P32929	405 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	STAT1	P42224	750 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MEA1	Q16626	185 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	STK32A	Q8WU08	396 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MSANTD3	Q96H12	275 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	NOX5	Q96PH1	765 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SYNC	Q9H7C4	482 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ECT2	Q9H8V3	914 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		18.6	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.6	■□□□□ 0.57

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