RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 PKDCCQ504Y2 493 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF276Q8N554 614 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 M0QYV0 167 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ADIGQ0VDE8 80 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 GJB7Q6PEY0 223 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 MIB1Q86YT6 1006 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 FAM81BQ96LP2 452 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 PRR23AA6NEV1 266 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 MBD3O95983 291 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ADH5P11766 374 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 OPRD1P41143 372 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 GAB4Q2WGN9 574 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO43Q4G163 708 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 HTR3DQ70Z44 454 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.17■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RNF40O75150 1001 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 TDGF1P13385 188 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 PON1P27169 355 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 RGS7P49802 495 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 NRLP54845 237 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 APBA1Q02410 837 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 EFEMP1Q12805 493 aa25.16■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.16■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.16■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 USP8P40818 1118 aa25.15■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 GAD2Q05329 585 aa25.15■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ12Q14500 433 aa25.15■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.15■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.15■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.15■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.15■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.14■■□□□ 1.62
SMKR1-201ENST00000462322 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.14■■□□□ 1.62
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SMKR1-201ENST00000462322 STC2O76061 302 aa25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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SMKR1-201ENST00000462322 MIIPQ5JXC2 388 aa25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM25Q86YD3 366 aa25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 PNKPQ96T60 521 aa25.13■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 USP34Q70CQ2 3546 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.12■■□□□ 1.61
SMKR1-201ENST00000462322 E7ENQ6 273 aa25.12■■□□□ 1.61
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