RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 RRAGAQ7L523 313 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF276Q8N554 614 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 TFAP2BQ92481 460 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 HESX1Q9UBX0 185 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-202ENST00000460160 ATG13O75143 517 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ADH5P11766 374 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 HOXA6P31267 233 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SLC6A11P48066 632 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 FNTBP49356 437 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 TKTL1P51854 596 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 MESP2Q0VG99 397 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PKDCCQ504Y2 493 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 HTR3DQ70Z44 454 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 C12orf40Q86WS4 652 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 UBA3Q8TBC4 463 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF132P52740 706 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 EML5Q05BV3 1969 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 K7EQS6 105 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ZBED1O96006 694 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CALCAP01258 141 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 RALAP11233 206 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G4AP47712 749 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SETSIPP0DME0 302 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 LONP2Q86WA8 852 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM25Q86YD3 366 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 MIB1Q86YT6 1006 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP18Q8N392 663 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ANTXRLA6NF34 631 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 GAD2Q05329 585 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ADIGQ0VDE8 80 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CNGA2Q16280 664 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 RUBCNQ92622 972 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PNKPQ96T60 521 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 HRO43593 1189 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 STC2O76061 302 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 Q6ZNB5 142 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 USP33Q8TEY7 942 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 KAT7O95251 611 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SEC13P55735 322 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 EFEMP1Q12805 493 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 STILQ15468 1287 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SYT13Q7L8C5 426 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 DCLK2Q8N568 766 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 ACDQ96AP0 544 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 THAP9Q9H5L6 903 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0A0MRY4 1105 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 M0QYV0 167 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-202ENST00000460160 GABBR2O75899 941 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms