RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.79■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.79■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 MDM4O15151 490 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 THAP12O43422 761 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 MED7O43513 233 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 LCP1P13796 627 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 KCNMA1Q12791 1236 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 PMF1Q6P1K2 205 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ZNF276Q8N554 614 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 VPS16Q9H269 839 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 CHRDQ9H2X0 955 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ACP6Q9NPH0 428 aa21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 CYP17A1P05093 508 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 WBP2Q969T9 261 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 EXOC4Q96A65 974 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 OTUB2Q96DC9 234 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 IER2Q9BTL4 223 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.77■■□□□ 1.08
VARS-218ENST00000459667 LAMTOR5O43504 91 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 EFEMP1Q12805 493 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 MTAPQ13126 283 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 CCINQ13939 588 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DHCR24Q15392 516 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 MEA1Q16626 185 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 MIB1Q86YT6 1006 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 SCML4Q8N228 414 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 HSFY1Q96LI6 401 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 CACNA1HO95180 2353 aa21.76■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 PIK3R2O00459 728 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GPD2P43304 727 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DAOAP59103 153 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 NCAPHQ15003 741 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 CD101Q93033 1021 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.75■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 E7ENQ6 273 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GABBR2O75899 941 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 ADH1CP00326 375 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GALK1P51570 392 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 PTK2Q05397 1052 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 Q6ZS52 159 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 HTR3DQ70Z44 454 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 IRGQQ8WZA9 623 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 ST7Q9NRC1 585 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.74■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GREM1O60565 184 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 FBXO21O94952 628 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 ADH5P11766 374 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 UCHL3P15374 230 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 ZNF18P17022 549 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DRD1P21728 446 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 COG7P83436 770 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 GAB4Q2WGN9 574 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 RNF139Q8WU17 664 aa21.73■■□□□ 1.07
VARS-218ENST00000459667 EDEM1Q92611 657 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms