RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 METTL23Q86XA0 190 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RAB43Q86YS6 212 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 LZTR1Q8N653 840 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OR5J2Q8NH18 312 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NSD2O96028 1365 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 IGF1RP08069 1367 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 UBE4BO95155 1302 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM189A2Q15884 450 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 XKRXQ6PP77 449 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 CD302Q8IX05 232 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 APOL6Q9BWW8 343 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ISCUQ9H1K1 167 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ACAD9Q9H845 621 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK13Q9HB14 408 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLAIN2Q9P270 581 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 MT-ND3P03897 115 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 SRP54P61011 504 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 B2MP61769 119 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PPIL2Q13356 520 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.76□□□□□ -1.49
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