RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 SLC6A11P48066 632 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 GAB4Q2WGN9 574 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ANO4Q32M45 955 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TADA2BQ86TJ2 420 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TFAP2BQ92481 460 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 OTUB2Q96DC9 234 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ULBP1Q9BZM6 244 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 PAEPP09466 180 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 KRT5P13647 590 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 PXNP49023 591 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 KDSRQ06136 332 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 EFEMP1Q12805 493 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 C12orf40Q86WS4 652 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 NAT16Q8N8M0 369 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 GBP4Q96PP9 640 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 M0QYV0 167 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 LILRB5O75023 590 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ZBED1O96006 694 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 HMBSP08397 361 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PLA2G4AP47712 749 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 GCNT1Q02742 428 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ADIGQ0VDE8 80 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 LPAL2Q16609 132 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 RAB41Q5JT25 222 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 BTBD8Q5XKL5 378 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PRR23BQ6ZRT6 265 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP18Q8N392 663 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SUMF1Q8NBK3 374 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 KREMEN1Q96MU8 473 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PNKPQ96T60 521 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PIK3R2O00459 728 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SETSIPP0DME0 302 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 LCP1P13796 627 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 RGS7P49802 495 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 GAD2Q05329 585 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 C2orf27AQ580R0 203 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 HTR3DQ70Z44 454 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM25Q86YD3 366 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SPHK2Q9NRA0 654 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 CLIC5Q9NZA1 410 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 NCDNQ9UBB6 729 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 DACH1Q9UI36 760 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 MYOFQ9NZM1 2061 aa29.12■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 KLHDC10Q6PID8 442 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 TPGS1Q6ZTW0 290 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 LONP2Q86WA8 852 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 IRF2BP1Q8IU81 584 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SFTPA1Q8IWL2 248 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 HHIPQ96QV1 700 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF4Q9NR80 690 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 RAB23Q9ULC3 237 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 APODP05090 189 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 GJB7Q6PEY0 223 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 DCLK2Q8N568 766 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 RUBCNQ92622 972 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 EPC1Q9H2F5 836 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ANTXRLA6NF34 631 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 K7EQS6 105 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 KAT7O95251 611 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 MESP2Q0VG99 397 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 CNGA2Q16280 664 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 GBP6Q6ZN66 633 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 BHMTQ93088 406 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ACDQ96AP0 544 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 MARCH2Q9P0N8 246 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 STRIP2Q9ULQ0 834 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 FRYLO94915 3013 aa29.09■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP54Q96N23 3096 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 GREM1O60565 184 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 STC2O76061 302 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 SLC9A1P19634 815 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 APBA1Q02410 837 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 STILQ15468 1287 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP44Q17R89 818 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-210ENST00000440825 PM20D1Q6GTS8 502 aa29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms