RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.88■■□□□ 1.09
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GPC1-202ENST00000420138 SNX24Q9Y343 169 aa21.88■■□□□ 1.09
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GPC1-202ENST00000420138 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 KLRC2P26717 231 aa21.83■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.83■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 RTP2Q5QGT7 225 aa21.83■■□□□ 1.09
GPC1-202ENST00000420138 FAM131BQ86XD5 332 aa21.83■■□□□ 1.09
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