RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SORL1Q92673 2214 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL7A1Q02388 2944 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PP11 408 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PQH9 124 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 F5H697 171 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLGNO14967 610 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPC1O15118 1278 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLR5O60602 858 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFCAB14O75071 495 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA2P01563 188 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1-17P01599 117 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCATP04180 440 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS1P07477 247 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAP2AP10114 183 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHKG2P15735 406 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TACR3P29371 465 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN7P35236 360 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE1AP54750 535 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPTEP56180 551 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MINDY4Q4G0A6 757 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC178Q5BJE1 867 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TREML2Q5T2D2 321 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1841Q6NSI8 718 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMBR1LQ6UX01 489 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANBP10Q6VN20 620 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZTK2 550 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBA1AQ71U36 451 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCF2L2Q86YR7 1114 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM109AQ8N4B1 249 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFHBQ8N7U6 833 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD44Q8N8A2 993 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDYL2Q8N8U2 506 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 JMYQ8N9B5 988 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D15Q8TC07 691 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEK9Q8TD19 979 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF480Q8WV37 535 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX33Q8WV41 574 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNRF4Q8WWF5 429 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM136AQ96C01 138 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 BICD1Q96G01 975 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 C18orf12Q96KH6 178 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF670Q9BS34 389 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLR10Q9BXR5 811 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARLQ9H300 379 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAREM1Q9H706 876 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB8Q9H765 288 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTN4Q9HB63 628 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERHLQ9NQF3 203 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF19AQ9NV58 838 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 OCIAD1Q9NX40 245 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOCS1Q9NZB8 636 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP2BPQ9P2M1 347 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 THEGQ9P2T0 379 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEU3Q9UQ49 428 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CKAP5Q14008 2032 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 UMODL1Q5DID0 1318 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PS18 150 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA13PA6NCF6 341 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 BECN2A8MW95 431 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 EYA2O00167 538 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 INPPL1O15357 1258 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADCY6O43306 1168 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 STRNO43815 780 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 UGDHO60701 494 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT-CO3P00414 261 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP1A2P05177 515 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLDP09622 509 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF17P17021 662 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITIH1P19827 911 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNA5P22460 613 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 XPAP23025 273 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FPR3P25089 353 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGB8P26012 769 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARK3P27448 753 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR15P49685 360 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCNN1BP51168 640 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRG3P56975 720 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVK-21P61565 698 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNB1P62873 340 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 MGAT5Q09328 741 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX10Q12887 443 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP69Q49AA0 526 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM47CQ5HY64 1035 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM63BQ5T3F8 832 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXW10Q5XX13 1052 aa-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms