RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 BVESQ8NE79 360 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D5Q92609 795 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GJA10Q969M2 543 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CCDC51Q96ER9 411 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 IWS1Q96ST2 819 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TIPINQ9BVW5 301 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PANK4Q9NVE7 773 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CD207Q9UJ71 328 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 B4DLN1 442 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MFAP3LO75121 409 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CSPG5O95196 566 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 KCNH1O95259 989 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GNA14O95837 355 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 THBDP07204 575 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ZNF131P52739 623 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CYP4A11Q02928 519 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ALCAMQ13740 583 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PPP2R5EQ16537 467 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 DCLK2Q8N568 766 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 USP33Q8TEY7 942 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 REEP2Q9BRK0 252 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GRM6O15303 877 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP6O43182 974 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CXCL10P02778 98 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SKILP12757 684 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 EDNRBP24530 442 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ICAM3P32942 547 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ADAM17P78536 824 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 LRMPQ12912 555 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ADAM15Q13444 863 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GIT2Q14161 759 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 NFIL3Q16649 462 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 MAN2A1Q16706 1144 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PTPN21Q16825 1174 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PRR31Q5SQ13 230 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 C4orf19Q8IY42 314 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 KYQ8NBH2 561 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 FRS2Q8WU20 508 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 DYDC2Q96IM9 177 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 PANX2Q96RD6 677 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms